Pilze sind Pflanzen.

Pilze den Pflanzen zuzuordnen war zunächst durchaus nachvollziehbar. Pilze und Schimmel wachsen aus Boden oder anderen Oberflächen, bleiben meist an einem Ort und bilden häufig verzweigte Strukturen. In älteren Klassifikationen, die stark auf sichtbarer Form und Lebensweise beruhten, passten sie gut in die Botanik.

Genauere Untersuchungen zeigten jedoch eine völlig andere Art der Ernährung.

Pflanzen betreiben Photosynthese und nutzen Lichtenergie, um organisches Material herzustellen. Pilze tun das nicht. Stattdessen geben sie Verdauungsenzyme an das Material in ihrer Umgebung ab und nehmen anschließend die kleineren Moleküle auf, die durch diese Verdauung entstehen.

Auch ihre Zellen unterscheiden sich in wichtigen Punkten. Pilzzellwände enthalten viel Chitin, während pflanzliche Zellwände vor allem aus Cellulose bestehen. Fortpflanzung und Zellorganisation folgen ebenfalls eigenen Mustern.

Im 20. Jahrhundert wurde es daher immer schwieriger, Pilze als ungewöhnliche Pflanzen zu behandeln. Robert Whittakers Fünf-Reiche-System von 1969 gab ihnen ein eigenes Reich.

DNA- und RNA-Vergleiche machten die evolutionäre Trennung später noch deutlicher. Pilze gehören zu einer Linie, die näher mit Tieren als mit Pflanzen verwandt ist.

Die Systematik innerhalb der Pilze wird durch genetische Daten weiterhin verfeinert. Pilze selbst sind jedoch klar als eigenständige große Abstammungslinie etabliert.