Urin in einer gesunden Harnblase ist steril; jedes dort nachgewiesene Bakterium bedeutet Verunreinigung oder Infektion.

Über Generationen war „steriler Urin“ ein medizinischer Grundsatz. Standardkulturen von Menschen ohne Harnwegsinfektion zeigten meist kein Wachstum, während der Nachweis typischer Bakterien gut zu klinischer Infektion passte. Daraus entstand die einfache Gleichung: Bakterien in der Blase = Krankheit oder Kontamination.

Diese Schlussfolgerung hing allerdings stark von den verwendeten Kulturbedingungen ab. Routineverfahren waren darauf ausgelegt, häufige Harnwegserreger schnell zu erkennen, nicht jede langsam wachsende oder anspruchsvolle Mikrobe nachzuweisen.

In den 2010er-Jahren kombinierten Forschende DNA-basierte Methoden mit erweiterten Kulturverfahren und Proben, die direkt aus der Blase gewonnen wurden. Dabei fanden sie wiederholt Bakterien auch bei Menschen ohne Symptome einer Infektion. Daraus entwickelte sich das Konzept einer Harnmikrobiota beziehungsweise eines Urobioms mit geringer Biomasse.

Die Probenentnahme bleibt besonders wichtig. Urin kann beim Verlassen der Blase Mikroorganismen aus Harnröhre und Haut aufnehmen; deswegen müssen Kontamination und tatsächliche Blasenmikrobiota sorgfältig unterschieden werden.

Ein Urobiom bedeutet ebenso wenig, dass Harnwegsinfektionen eingebildet sind. Infektion hängt von Symptomen, Entzündung, Keimart, Keimzahl und klinischem Kontext ab. Die Korrektur lautet lediglich, dass eine gesunde Harnblase nicht zwingend mikrobiologisch leer ist.